Le traitement d’image dans le domaine de la Biologie et du Médical est crucial pour plusieurs secteurs. On peut citer par exemple celui de la Recherche et de l’Industrie. En effet, de plus en plus d’applications requièrent des traitements et de l’analyse d’image.
Plusieurs techniques de microscopie sont couramment utilisées dans la recherche publique ou privée. Chacune génèrent des besoins d’analyses sur-mesures et adaptées à chaque projet.
Citons par exemple :
- Le FISH et FISH séquentiel,
- La microscopie électronique,
- Le light-sheet,
- La microscopie confocale,
- …
Les besoins sont aussi dans l’étude d’image provenant d’autres sources comme l’IRM, le TEP, ou tout simplement des caméras filmant un patient et pouvant permettre d’avoir accès à des informations utiles dans la recherche, le diagnostic, ou le traitement de maladies.
L’analyse d’images en Biologie
L’analyse des images obtenus par microscopie permettent d’étudier des phénomènes divers, comme par exemple :
- La distribution de certaines molécules dans des tissus comme dans des applications de transcriptomique spatiale),
- La segmentation de certains objets au niveau de cellules uniques (comme des organelles, des régions d’ADN, ou encore des condensats qui sont utiles dans l’étude des phénomènes de LLPS),
- La segmentation des organismes, comme par exemple des bactéries,
- La Classification de cellules (dans un tissu ou par exemple, dans une application de cell sorting),
- Et le tracking des cellules ou d’autres organismes.
L’amélioration d’images en Biologie
Souvent, les conditions d’imageries complexes impliquent que les images obtenues doivent être préparées pour être exploitables. Parmi les besoins les plus courants on trouve :
- L’amélioration de la qualité d’image,
- La correction du décalage entre images prises dans un intervalle de temps,
- La réduction du bruit de fond avec des algorithmes de denoising et de déconvolution,
- La normalisation de l’intensité lumineuse dans l’image,
- La correction des aberrations chromatiques,
- …
Il est alors très commun d’utiliser ces améliorations en Biologie.
Les systèmes d’aide à la décision Médicale
L’utilisation des modèles de Deep Learning dans le domaine médical peut aider à la prise de décision et au diagnostic des maladies, ou encore aider à améliorer et mieux protéger les patients. Plusieurs applications peuvent ainsi être développées dans ce but.
Le Deep Learning pour l’amélioration d’images médicales
L’IA peut aider dans la prise de décision au moment du diagnostic. En effet, les images issues de ces diagnostics peuvent servir à entrainer des modèles d’IA pour reconnaître des tumeurs. Actuellement, il existe des applications comme l’amélioration de la qualité d’image des tomographies.
Ainsi, les doses de radiation peuvent être réduites pour diminuer l’exposition du patient. La perte de signal sera rattrapée par l’amélioration algorithmique des images.
Un cas concret : la super-résolution
Nous pouvons aussi citer un exemple d’amélioration d’image avec inférences IA dans le cadre de la super-résolution.
La super-résolution a pour objectif d’ajouter de l’information à un signal brut (ici des pixels). Ainsi nous réalisons artificiellement un upscale controlé des images pour en augmenter la résolution et donc faciliter l’analyse et l’interprétation médicale.
Pour avoir plus d’informations, nous avons déjà réalisé plusieurs articles sur la super-résolution :
- De la super-résolution temps réel et embarquée
- Amélioration d’images : de la Super-Résolution avec du Deep Learning
En bref
Comme nous l’avons brièvement décrit, que ce soit dans la recherche publique ou privée, ou encore dans le domaine Médical, l’analyse d’image est un outil indispensable.
Notre expertise en traitement d’image, création d’algorithme et développement de modèle d’intelligence artificielle spécifique, nous permet de proposer des solutions pertinentes et de vous accompagner dans les différentes étapes de votre projet.
Enfin, les domaines de la Biologie et du Médical sont très souvent liés à celui de la Mécanique des Fluides. Nous développons aussi des diagnostics optiques particulaires pour caractériser ces écoulements.
Que vous soyez un laboratoire de Recherche, ou une Entreprise, vous pouvez nous contacter pour obtenir une solution adaptée à vos besoins, notamment pour le traitement d’image dans le domaine de la Biologie et du Médical.